עלות הטיפול התרופתי השבועי להשמנה משתנה בהתאם לסוג הטיפול, למסגרת הביטוחית ולזכאות האישית של כל מטופל. כיום הטיפולים התרופתיים השבועיים להשמנה נכללים במסגרת הביטוחים המשלימים של כלל קופות החולים, ולכן העלות עשויה להיות נמוכה משמעותית מהמחיר המלא. ייתכנו פערים של מאות שקלים בחודש בין טיפול תרופתי שבועי אחד למשנהו, ומטופלים רבים אינם מודעים לכך שעשויה להיות זכאות להשתתפות במסגרת הביטוח המשלים.
 
מאחר שטיפול בהשמנה הוא לרוב טיפול ארוך טווח, חשוב להביא בחשבון גם את העלות לאורך זמן ואת היכולת להתמיד בו. מומלץ לשוחח עם הרופא על כלל השיקולים: היעילות, תופעות הלוואי, ההתאמה הרפואית והעלות, ולבדוק את אפשרויות הכיסוי בקופת החולים לפני קבלת ההחלטה.